Arıcı: Ölüm Kovanı 2, geçmişte görev yaptığı gizli örgütün tehlikeli planlarını durdurmak için yeniden harekete geçen eski özel servis ajanı Adam Clay'in ölümcül mücadelesini konu ediyor. Bir zamanlar devlet adına son derece gizli ve tehlikeli operasyonlar gerçekleştiren Adam Clay, yaşadığı olayların ardından geçmişini geride bırakarak sakin bir hayat sürmeye çalışır. Ancak masum insanları hedef alan büyük bir dolandırıcılık ağını ortaya çıkarması ve bu örgütün arkasındaki güçlü isimlerle hesaplaşması, onu yeniden karanlık dünyanın içine sürükler.
İlk filmde yaşananların ardından artık aranan bir adama dönüşen Clay, kendisine yapılanların hesabını sormaktan ve adaleti kendi yöntemleriyle sağlamaktan vazgeçmez. Bu kez karşısındaki tehdit, geçmişte bağlı olduğu ve Beekeeper adıyla bilinen gizli örgütün kendisidir. Masum insanları korumak ve toplumdaki güç dengesini sürdürmek amacıyla faaliyet gösteren örgüt, zamanla kuruluş amacından uzaklaşarak kendi çıkarları doğrultusunda hareket etmeye başlar. Örgütün Amerikan hükümetini kontrol altına almaya yönelik planları, Clay'i eski müttefiklerine karşı mücadele etmeye zorlar.
Bir zamanlar parçası olduğu yapının kontrolden çıktığını öğrenen Clay, örgütün gerçek hedeflerini ortaya çıkarmak ve yaklaşan felaketi önlemek için harekete geçer. Ancak Beekeeper üyeleri, onun eğitiminden geçmiş, en az kendisi kadar tehlikeli ve ölümcül yöntemlere başvurmaktan çekinmeyen profesyonellerdir. Clay, eski bağlantılarının ve geçmişte edindiği bilgilerin yardımıyla örgütün planlarını çözmeye çalışırken kendisini giderek büyüyen bir komplonun ortasında bulur.
Örgütün hedefinde yalnızca devlet kurumları değil, doğrudan Amerika Birleşik Devletleri Başkanı Jessica Danforth da bulunmaktadır. Başkanın güvenliğinin tehlikeye girmesiyle birlikte Clay'in mücadelesi kişisel bir hesaplaşmanın ötesine geçer. Eski CIA yöneticisi Wallace Westwyld ve olayları araştıran FBI ajanları Verona Parker ile Matt Wiley de bu karmaşık güç mücadelesinin önemli isimleri arasında yer alır.
Giderek daha tehlikeli hale gelen çatışmada Clay, kendisini yetiştiren örgütün kullandığı yöntemleri çok iyi bilmesine rağmen her adımda yeni düşmanlarla karşılaşır. Kime güvenebileceğini belirlemek zorlaşırken geçmişte öğrendiği bütün becerilerini bu kez eski silah arkadaşlarına karşı kullanmak zorunda kalır. Devletin en üst kademelerine uzanan tehdit karşısında zaman daralırken Clay, hem başkanı korumak hem de kontrolden çıkan örgütün planlarını engellemek için ölümcül bir mücadeleye girişir.
Jason Statham'ın yeniden Adam Clay karakterini canlandırdığı Arıcı: Ölüm Kovanı 2, ihanet, intikam ve güç mücadelesini merkezine alan hikayesiyle, eski bir ajanın kendisini yetiştiren sisteme karşı verdiği savaşı anlatıyor.